Nel perimetro dell'attuale parco erano già presenti nel 1800 alberi di una certa importanza, dei quali si tutelò la conservazione, di questo sono testimoni gli alberi più vecchi del parco ancora viventi che superano i 200 anni di età.

Il parco prende origine da un residuo della foresta planiziale padana, che era fatta di specie come il carpino bianco, la farnia, l'acero campestre, l'ontano e il pioppo nero. Fra gli arbusti di sottobosco si rinvengono il nocciolo, l'edera e la vitalba, mentre fra le specie che crescono a livello del suolo spiccano il pungitopo, la pervinca e tante altre ancora.

Nel parco delle bertone ritroviamo una composizione del sottobosco analoga a quella della foresta padana se si fa eccezione della convallaria che borda i sentieri e le aiuole. Ma è soprattutto nella vegetazione arborea che l'intervento dell'uomo è evidente con l'innesto nel parco di specie poco comuni e non di origine europea usate per ricreare scorci paesaggistici, giochi di colore nei periodi di fioritura e ovunque un ambiente sempre gradevole. In conseguenza di queste trasformazioni apportate negli anni la configurazione del parco è distinguibile in varie zone caratterizzate da proprie connotazioni, sia nella distribuzione delle aree che nella composizione della flora di sottobosco e di alto fusto così distribuite:

• prima zona: è quella adiacente all'ingresso in questa area si riescono ancora a vedere le aiuole circondate dalla convallaria e ricoperte dalla pervinca attraversate da sentieri e vialetti di accesso al parco. Le piante che popolano questa zona sono di alto fusto come il pino nero, liriodendrom tulipifera (una varietà di pioppo molto imponente), alternati a piante più decorative e caratteristiche dei parchi dell'ottocento come le magnolie e i tassi, questa zona era stata creata per permettere di passeggiare sempre all'ombra senza troppo allontanarsi dalla villa.
• seconda zona: è quella che circonda i fabbricati del parco, qui troviamo una radura erbosa che un tempo era ghiaiata, ai bordi si trovano poche piante come le magnolie, il libocedro e cespugli di lauro, mentre vicino ai fabbricati fioriscono rosai e si arrampica la vite canadese.
• terza zona: circonda il laghetto e qui il parco gradualmente diviene bosco anche se il tutto è stato guidato dalla mano dell'uomo, troviamo latifoglie come le querce, carpini, bagolari e molte altre molto rare come il gimko biloba e il kaki. Vicino al laghetto troviamo un boschetto di magnolie, angoli con cespugli di ortensie ed aree dedicate alla sosta con panchine in pietra.
• quarta zona: è quella che si sviluppa al centro del laghetto dove la vegetazione arborea si è sviluppata in libertà raggiungendo un equilibrio naturale, il sottobosco è rappresentato da piante di pungitopo, pervinca e convallaria. In alcune zone troviamo piante di sambuco, cespugli di nocciolo, e di bosso. Verso l'acqua il bambù fa la sua presenza così come una sola pianta di elleboro.